O acervo do Centro Digital de Documentação e Pesquisa Memórias do Sul da Bahia está organizado por Coleções Temáticas, que buscam contemplar a diversidade social, política, linguística, econômica, histórica e cultural do Sul e Extremo Sul da Bahia. Através de um trabalho coletivo de pesquisa e garimpagem de histórias, memórias e arquivos, queremos disponibilizar documentos de cunho histórico, etnográfico, linguístico, jurídico etc., em diversos suportes (textual, imagético, cartográfico, audiovisual, etc), fomentando, dessa forma, uma pesquisa democrática e uma reflexão crítica sobre história e a memória da região. 

Até o momento estamos trabalhando na organização das seguintes Coleções Temáticas: História indígena e do indigenismo no Sul e Extremo Sul da Bahia; Memórias de guerra no Sul da Bahia, Mensagens na garrafa e Memórias quilombolas no Sul da Bahia. 

Outras Coleções Temáticas sobre terreiros e falas, pescadores, marisqueiras e quilombolas, meio ambiente e distritos da região, estão em processo de construção. Tão logo elas estejam organizadas iremos publicá-las no nosso site.